Регалии: В качестве тренера - Обладатель Золотого кубка КОНКАКАФ (2009); серебряный призер Кубка Америки (2001); чемпион Мексики (1999).
Родился 1 декабря 1958 года в Мехико (Мексика).
Хавьер Агирре в бытность игроком выступал на позиции полузащитника за мексиканские клубы, а также в США и Испании, где защищал цвета «Осасуны» (1986-1987).
За сборную Мексики провел 59 матчей, забил 13 мячей.
Завершив выступления, перешел на тренерскую работу. Возглавлял мексиканские клубы, испанские «Осасуну» (2002-2006), мадридский «Атлетико» (2006-2009), «Сарагосу» (2010-2011), «Эспаньол» (2012-2014).
В 2001 году сборная Мексики под руководством Хавьера Агирре стала серебряным призером Кубка Америки, уступив в финале колумбийцам.
С 2009 по 2010 год снова был главным тренером мексиканской сборной, с которой выиграл Золотой Кубок КОНКАКАФ и дошел до 1/8 финала на чемпионате мира в ЮАР (мексиканцы проиграли аргентинцам - 1:3).
С 2014 по 2015 год возглавлял сборную Японии, затем клуб «Аль-Вахда» из ОАЭ. Тренировал также сборную Египта (2018-2019), испанские "Леганес" (2019-2020) и "Мальорку" (2022-2024), мексиканский "Монтеррей" (2021-2022). В 2024 году в третий раз получил назначение на пост главного тренера сборной Мексики.