Регалии: Заслуженный мастер спорта; обладатель Кубка УЕФА (2005); 2-кратный чемпион России (2005, 2006); 3-кратный серебряный (2004, 2008, 2010) и 2-кратный бронзовый (2007, 2012) призер чемпионатов России; 5-кратный обладатель Кубка России (2005, 2006, 2008, 2009, 2011); 4-кратный обладатель Суперкубка России (2004, 2006, 2007, 2009); победитель Кубка Первого канала (2007); 2-кратный лучший полузащитник оборонительного плана в России (2002, 2004).
Родился 22 января 1980 года в Алупке, Крым.
Евгений Алдонин - опорный полузащитник, воспитанник детской школы города Алупка. В 16-летнем возрасте Евгений переехал в Волгоград, где учился в спортивном интернате «Ротора». В этой команде и состоялся дебют Алдонина в 1997 году (с 2000 года выступал за основной состав «Ротора»).
В 2004 году полузащитник перешел в ЦСКА, цвета которого защищал до 2012 года и с которым выиграл Кубок УЕФА, два чемпионата России и пять Кубков страны. Играл также за саранскую "Мордовию" (2012-2013 - аренда), нижегородскую "Волгу" (2013-2014) и красногорский "Зоркий" (2017-2018).
За сборную России выступал с 2002 по 2007 год, провел 29 матчей, в том числе на чемпионате Европы 2004 года.