Регалии: Заслуженный мастер спорта СССР; 4-кратный чемпион СССР (1943, 1944, 1946, 1947) в плавании на 100 метров баттерфляем (дважды) и эстафете 3х100 метров.
Родился 28 апреля 1912 года в селе Марьевка (ныне Николаевская область, Украина).
Семен Бойченко во время службы в Красной армии был моряком Черноморского флота. Здесь он неоднократно выигрывал соревнования по плаванию, в том числе заплывы на дальние расстояния.
Выступал за СКА ВМФ, Центральный институт физкультуры (1932-1936), ЦДКА (1937-1940), а с 1941 года - за московский «Спартак».
Бойченко установил несколько Всесоюзных рекордов, а перед самой Великой Отечественной войной превысил мировые рекорды в плавании на 100 и 200 метров баттерфляем, но эти достижения не были ратифицированы.
В 1948 году Семен Бойченко был арестован за антисоветскую пропаганду и осужден на десять лет. Лишь через год после смерти Иосифа Сталина спортсмена выпустили на свободу, а потом полностью реабилитировали.
В последующие годы Бойченко успешно тренировал, входил в тренерский штаб сборной СССР по плаванию на Олимпийских играх 1960 года.
Скончался 23 января 1987 года в Москве. Похоронен на Преображенском кладбище.