Регалии: Серебряный призер чемпионата Европы (1996); бронзовый призер Кубка Конфедераций (1997); обладатель Кубка УЕФА (1997); футболист года в Чехии (1997); 2-кратный чемпион Чехословакии (1991, 1993); 2-кратный обладатель Кубка Чехословакии (1990, 1992); 2-кратный обладатель Кубка Германии (2001, 2002).
Родился 16 мая 1966 года в Пацове (Чехословакия).
Отыграв три сезона за пражскую «Дуклу», Немец перешел в стан злейшего врага клуба - в «Спарту», в которой также провел три сезона. В 1993 году Иржи Немец стал игроком «Шальке 04». За клуб из Гельзенкирхена провел в общей сложности 257 матчей, выиграв Кубок УЕФА и два Кубка Германии.
За национальную команду полузащитник выступал с 1990 по 2001 год (84 матча, 1 гол). 36 раз выводил сборную Чехии на поле в качестве капитана. В составе команды стал серебряным призером Евро-1996.
После окончания карьеры игрок перешел на тренерскую работу. С 2006 по 2009 год возглавлял пражскую «Дуклу».