Родился 25 июля 1973 года в Москве.
Андрей Ватутин - один из самых успешных российских баскетбольных менеджеров. Окончив факультет журналистики МГУ, работал спортивным обозревателем, а также был пресс-атташе Российской федерации баскетбола.
С 2000 по 2002 год являлся помощником генерального директора пермского баскетбольного клуба «Урал-Грейт» и помощником генерального менеджера мужской сборной России.
В 2002 году Ватутин перешел в ЦСКА, где работал заместителем генерального директора, генеральным директором, первым вице-президентом и президентом клуба.
За годы работы Ватутина в ЦСКА армейцы четырежды первенствовали в Евролиге в сезонах 2005/06, 2007/08 и 2015/16, 2018/19.